《表觀遺傳大革命》導讀:演奏生命樂章的交響樂團——一切必須由神奇的DNA說起

  发布时间:2024-05-19 21:09:07   作者:玩站小弟   我要评论
文:阮麗蓉中央研究院基因體研究中心研究員)【導讀】表觀遺傳——演奏生命樂章的交響樂團生命存在於地球已超過四十億年,然而在一九五三年之前,人類對於生命運行代代相傳的機制所知極其有限。何其幸運,半個多世紀 。

文:阮麗蓉(中央研究院基因體研究中心研究員)

【導讀】表觀遺傳——演奏生命樂章的交響樂團

生命存在於地球已超過四十億年,然而在一九五三年之前,表觀人類對於生命運行代代相傳的遺傳機制所知極其有限。何其幸運,大革讀演的半個多世紀以來,命導命樂扭轉人類命運的奏生章生命科學突破,已把人類推上史無前例的交響高峰,我們已經身處生命科學的樂團黃金時代!

一切必須由神奇的切必DNA說起

一九五三年之前,科學家已理解,須由DNA極可能隱藏龍生龍、神奇說起鳳生鳳的生物遺傳密碼,然而知其然不知其所以然,表觀對於遺傳機制仍是遺傳一頭霧水。

這困擾無數頂尖科學家,大革讀演的堪稱人類史上最重大的謎團,一九五三年由華生和克里克博士四兩撥千斤,輕鬆巧妙的解開。華生和克里克博士發現,由不斷重複的磷酸根、五碳糖和四種鹼基ATCG串成的DNA【註】可以形成穩定的雙股螺旋結構 【1】,兩股DNA彼此的鹼基可準確相互配對結合(A配T,C配G)。於是,細胞生長分裂前DNA複製時,雙股螺旋分開,分開的兩股DNA都成了模板,DNA聚合酶按著模板製造出另一股擁有完全相同鹼基序列的DNA,再次形成雙股螺旋結構,平均分配到兩個分裂之後的子細胞。

憑藉這僅僅一頁劃時代的DNA雙股螺旋結構論文,華生和克里克博士,與提供DNAX光繞射圖的維爾金博士,共同獲得一九六二年諾貝爾生理醫學獎,堪稱是諾貝爾獎中的諾貝爾獎。

如此完美的DNA複製機制,瞬間解開生物遺傳奧秘,生命科學正式脫離蝸牛慢爬,搭上太空梭前進。

克里克博士進一步提出遺傳訊息中心法則 (The Central Dogma),說明 DNA可以被轉錄為RNA,RNA 被轉譯為蛋白質。DNA上的鹼基序列,決定最終形成何種蛋白質【2】

花花世界萬千生物之所以形態各異,人體組織器官複雜,端賴各式細胞在個體發育成長階段產生各種蛋白質,各司其職。

一九九○年,耗資三十億美金的人類基因組定序計畫正式啟動,歷時十三年,於二○○三年公布完整DNA序列圖譜【3】。眼見為憑,人類首次清楚看見「我是誰」的三十億個DNA鹼基生命之書,以為從此可知天命……

但天不從人願,顯而易見的問題立刻浮現:

人類擁有 30 ± 0.5 × 1012顆細胞【4】,除少部分免疫細胞例外,每一顆細胞中的DNA序列基本完全一致,然而為何有些細胞發展成了眼睛,有些細胞發展成了骨頭,有些細胞發展成了心臟?

同卵雙胞胎有著同樣序列的DNA,儘管外貌相似,為何後天命運卻大不同? 比如其中之一天天吃炸雞薯條可樂,高血糖高脂肪高血壓三高纏身,未老先衰。而另一位奉行健康飲食作息,成了歲月無痕的美魔女。

究竟是何機制,讓同一份生命之書,展現不同的命運?

該表觀遺傳上場啦

表觀遺傳泛指一種生物機制,能夠在不改變DNA鹼基序列的情況之下,控制特定區段的DNA(基因),在特定發育時間特定身體部位的細胞中,被轉錄成RNA,之後轉譯為蛋白質,行使生物功能(表觀)。並且這種表觀變化,在大部分的情形之下,能夠遺傳。

倘若DNA的鹼基排列是生命五線譜上的音符,那麼表觀遺傳則是演奏這首生命之歌的交響樂團。缺乏表觀遺傳調控,五線譜僅僅是靜靜躺在桌上的一本樂譜,無法發出美妙的音樂,也就是生命。有了表觀遺傳調控,音符得以化為音樂,表現生命現象,時而行雲流水,時而靜默無聲,時而慷慨激昂。

那麼表觀遺傳如何調控基因表現呢?

我們以人類為例來說明。人類屬於真核生物,真核生物的DNA並不是裸露在細胞核中,而是被四種帶正電的組蛋白H2A、H2B、H3和H4包裹成串珠狀的核小體(nucleosome),核小體再以特定的結構堆疊成染色質(chromatin)。DNA上一長串的磷酸根讓DNA帶負電,被帶正電的組蛋白包裹,正負相吸,一拍即合,結構緊密,不容易被轉錄成RNA。

一九六○年代起科學家開始理解,在生物發育過程中不同區段的DNA和組蛋白會被加上不同的化學官能基,並藉此控制該段DNA是否被轉錄成RNA。

DNA上最被廣為研究的表觀遺傳化學官能基非甲基(CH3)莫屬。如前所述,DNA由四個鹼基ATCG構成,而DNA甲基化就發生在鹼基C的第五個碳原子上,稱為5mC (5-methyl cytosine)。

已知DNA插上甲基可抑制轉錄,主要證據來自一九八九年博德教授(Adrian Bird)的重大發現。伯德教授找到第一個可以辨認並且結合DNA甲基的蛋白質MeCP2 (methyl-CpG binding protein),發現MeCP2 帶來一些蛋白質夥伴,具有抑制轉錄的活性,於是闡明甲基抑制DNA轉錄的機制【5】

一九九九年,左格比醫師(Huda Zoghbi)更發現,MeCP2突變是造成神經發育障礙雷特氏症(Rett syndrome)的主要原因【6】。這些研究明確指出,表觀遺傳失調可造成人類疾病。博德教授更早於一九七八年便發現,DNA甲基化能隨著DNA複製機制,忠實的被傳遞至新合成的DNA上同樣相對位置的鹼基C【7】

也就是說,DNA甲基可以被遺傳至下一代。

那麼要如何除去甲基讓DNA可以被轉錄成RNA呢?生物體內是否存在 DNA去甲基酶是表觀領域的大哉問。尋尋覓覓,終於在二○○九至二○一一年間,拉奧(Anjana Rao)、張毅和徐國良三位科學家陸續發現,DNA去甲基酶TET家族蛋白可將5mC氧化為5hmC、5fC和5caC,讓DNA可以被轉錄成RNA【8】


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